Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htra4A2RT60 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms