Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms