Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scn3aA2ASI5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn3aA2ASI5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn3aA2ASI5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn3aA2ASI5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn3aA2ASI5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn3aA2ASI5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn3aA2ASI5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn3aA2ASI5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn3aA2ASI5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn3aA2ASI5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn3aA2ASI5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn3aA2ASI5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn3aA2ASI5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn3aA2ASI5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn3aA2ASI5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn3aA2ASI5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn3aA2ASI5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn3aA2ASI5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn3aA2ASI5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn3aA2ASI5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn3aA2ASI5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn3aA2ASI5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms