Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtcflA2APF3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
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