Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Frmpd1A2AKB4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Frmpd1A2AKB4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Frmpd1A2AKB4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Frmpd1A2AKB4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
Frmpd1A2AKB4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Frmpd1A2AKB4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Frmpd1A2AKB4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Frmpd1A2AKB4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Frmpd1A2AKB4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Frmpd1A2AKB4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Frmpd1A2AKB4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Frmpd1A2AKB4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Frmpd1A2AKB4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Frmpd1A2AKB4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Frmpd1A2AKB4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Frmpd1A2AKB4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Frmpd1A2AKB4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Frmpd1A2AKB4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Frmpd1A2AKB4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Frmpd1A2AKB4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Frmpd1A2AKB4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Frmpd1A2AKB4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Frmpd1A2AKB4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Frmpd1A2AKB4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Frmpd1A2AKB4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Frmpd1A2AKB4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Frmpd1A2AKB4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Frmpd1A2AKB4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Frmpd1A2AKB4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
Frmpd1A2AKB4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Frmpd1A2AKB4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Frmpd1A2AKB4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Frmpd1A2AKB4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Frmpd1A2AKB4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Frmpd1A2AKB4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Frmpd1A2AKB4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Frmpd1A2AKB4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Frmpd1A2AKB4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Frmpd1A2AKB4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
Frmpd1A2AKB4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Frmpd1A2AKB4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Frmpd1A2AKB4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Frmpd1A2AKB4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Frmpd1A2AKB4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Frmpd1A2AKB4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Frmpd1A2AKB4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Frmpd1A2AKB4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Frmpd1A2AKB4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Frmpd1A2AKB4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Frmpd1A2AKB4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Frmpd1A2AKB4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Frmpd1A2AKB4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Frmpd1A2AKB4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Frmpd1A2AKB4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Frmpd1A2AKB4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Frmpd1A2AKB4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Frmpd1A2AKB4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Frmpd1A2AKB4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Frmpd1A2AKB4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Frmpd1A2AKB4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Frmpd1A2AKB4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Frmpd1A2AKB4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Frmpd1A2AKB4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Frmpd1A2AKB4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Frmpd1A2AKB4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Frmpd1A2AKB4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Frmpd1A2AKB4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Frmpd1A2AKB4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Frmpd1A2AKB4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Frmpd1A2AKB4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Frmpd1A2AKB4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Frmpd1A2AKB4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Frmpd1A2AKB4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Frmpd1A2AKB4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Frmpd1A2AKB4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Frmpd1A2AKB4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Frmpd1A2AKB4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Frmpd1A2AKB4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Frmpd1A2AKB4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Frmpd1A2AKB4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Frmpd1A2AKB4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Frmpd1A2AKB4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Frmpd1A2AKB4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Frmpd1A2AKB4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Frmpd1A2AKB4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Frmpd1A2AKB4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Frmpd1A2AKB4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Frmpd1A2AKB4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Frmpd1A2AKB4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Frmpd1A2AKB4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Frmpd1A2AKB4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Frmpd1A2AKB4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Frmpd1A2AKB4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Frmpd1A2AKB4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Frmpd1A2AKB4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Frmpd1A2AKB4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Frmpd1A2AKB4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Frmpd1A2AKB4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Frmpd1A2AKB4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.4 ms