Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc183A2AJB1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc183A2AJB1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms