Protein–RNA interactions for Protein: A2A958

C87977, Expressed sequence C87977, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87977A2A958 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C87977A2A958 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C87977A2A958 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C87977A2A958 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C87977A2A958 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C87977A2A958 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C87977A2A958 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C87977A2A958 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C87977A2A958 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C87977A2A958 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C87977A2A958 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C87977A2A958 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C87977A2A958 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C87977A2A958 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C87977A2A958 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C87977A2A958 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C87977A2A958 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C87977A2A958 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C87977A2A958 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C87977A2A958 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C87977A2A958 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C87977A2A958 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C87977A2A958 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C87977A2A958 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C87977A2A958 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C87977A2A958 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C87977A2A958 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C87977A2A958 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C87977A2A958 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C87977A2A958 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C87977A2A958 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C87977A2A958 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C87977A2A958 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms