Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calcoco2A2A6M5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calcoco2A2A6M5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calcoco2A2A6M5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms