Protein–RNA interactions for Protein: A2A3V1

Akap17b, A-kinase anchor protein 17B, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap17bA2A3V1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Akap17bA2A3V1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Akap17bA2A3V1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Akap17bA2A3V1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Akap17bA2A3V1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Akap17bA2A3V1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Akap17bA2A3V1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms