Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4921501E09RikA0A0R4J054 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
4921501E09RikA0A0R4J054 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms