Protein–RNA interactions for Protein: A0A0M3U1B0

Sycp2l, Synaptonemal complex protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2lA0A0M3U1B0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms