Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JFS9

Atg4a-ps, Cysteine protease, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg4a-psA0A0G2JFS9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms