Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms