Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H9

Igkv1-132, Immunoglobulin kappa variable 1-132 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms