Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms