Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trpc2Q9R244 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trpc2Q9R244 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trpc2Q9R244 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Trpc2Q9R244 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Trpc2Q9R244 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Trpc2Q9R244 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Trpc2Q9R244 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Trpc2Q9R244 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Trpc2Q9R244 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Trpc2Q9R244 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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