Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms