Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Wdr54Q9R0D8 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1890.6 ms