Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

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Length 761 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Phtf1Q9QZ09 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Phtf1Q9QZ09 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Phtf1Q9QZ09 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Phtf1Q9QZ09 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Phtf1Q9QZ09 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Phtf1Q9QZ09 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Phtf1Q9QZ09 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Phtf1Q9QZ09 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Phtf1Q9QZ09 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Phtf1Q9QZ09 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phtf1Q9QZ09 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phtf1Q9QZ09 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phtf1Q9QZ09 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phtf1Q9QZ09 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phtf1Q9QZ09 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phtf1Q9QZ09 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phtf1Q9QZ09 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phtf1Q9QZ09 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phtf1Q9QZ09 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phtf1Q9QZ09 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phtf1Q9QZ09 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phtf1Q9QZ09 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Phtf1Q9QZ09 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Phtf1Q9QZ09 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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