Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms