Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 AC132384.10-201ENSMUST00000217862 1204 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrfQ9JM73 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms