Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Rabgef1Q9JM13 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Rabgef1Q9JM13 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Rabgef1Q9JM13 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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Rabgef1Q9JM13 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Rabgef1Q9JM13 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Rabgef1Q9JM13 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Rabgef1Q9JM13 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Rabgef1Q9JM13 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Rabgef1Q9JM13 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Rabgef1Q9JM13 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Rabgef1Q9JM13 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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