Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm18621-201ENSMUST00000222677 679 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm21577-201ENSMUST00000190823 697 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm20802-201ENSMUST00000190832 698 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Bpifa5-201ENSMUST00000028986 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
SacsQ9JLC8 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms