Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms