Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms