Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ap3m1Q9JKC8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms