Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Tuba8Q9JJZ2 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms