Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rb1cc1Q9ESK9 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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Rb1cc1Q9ESK9 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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Rb1cc1Q9ESK9 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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Rb1cc1Q9ESK9 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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Rb1cc1Q9ESK9 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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Rb1cc1Q9ESK9 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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Rb1cc1Q9ESK9 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms