Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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