Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
DysfQ9ESD7 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms