Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
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Usp29Q9ES63 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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