Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx6Q9ER75 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Irx6Q9ER75 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Irx6Q9ER75 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Irx6Q9ER75 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Irx6Q9ER75 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Irx6Q9ER75 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Irx6Q9ER75 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx6Q9ER75 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms