Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms