Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Tspan4Q9DCK3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Tspan4Q9DCK3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Tspan4Q9DCK3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Tspan4Q9DCK3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Tspan4Q9DCK3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Tspan4Q9DCK3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Tspan4Q9DCK3 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Tspan4Q9DCK3 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Tspan4Q9DCK3 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tspan4Q9DCK3 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
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Tspan4Q9DCK3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Tspan4Q9DCK3 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Tspan4Q9DCK3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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