Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC61

Pmpca, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, mousemouse

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Length 524 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcaQ9DC61 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PmpcaQ9DC61 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PmpcaQ9DC61 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms