Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Abcg8Q9DBM0 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms