Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms