Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntd1Q9D995 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms