Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 1700019C18Rik-203ENSMUST00000222085 1766 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Gtf3c6Q9D8P7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Gtf3c6Q9D8P7 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Prr30-201ENSMUST00000057718 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Gtf3c6Q9D8P7 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Gtf3c6Q9D8P7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Gtf3c6Q9D8P7 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Acox2-204ENSMUST00000164598 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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