Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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