Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Nop56Q9D6Z1 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nop56Q9D6Z1 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
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Nop56Q9D6Z1 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Nop56Q9D6Z1 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Nop56Q9D6Z1 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Nop56Q9D6Z1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Nop56Q9D6Z1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Nop56Q9D6Z1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Nop56Q9D6Z1 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Nop56Q9D6Z1 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Nop56Q9D6Z1 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Nop56Q9D6Z1 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Nop56Q9D6Z1 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nop56Q9D6Z1 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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