Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PudpQ9D5U5 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 323.8 ms