Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrameQ9D4Z5 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms