Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D4W2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D4W2 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D4W2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D4W2 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms