Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
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Snx29Q9D3S3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Snx29Q9D3S3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Snx29Q9D3S3 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Snx29Q9D3S3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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