Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spns3Q9D232 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms