Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl28Q9D1B9 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Mrpl28Q9D1B9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Mrpl28Q9D1B9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Mrpl28Q9D1B9 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Mrpl28Q9D1B9 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Mrpl28Q9D1B9 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Mrpl28Q9D1B9 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Mrpl28Q9D1B9 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Mrpl28Q9D1B9 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Mrpl28Q9D1B9 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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