Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms