Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms