Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWL8

Ctnnbl1, Beta-catenin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbl1Q9CWL8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbl1Q9CWL8 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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